有關臥龍潭的來曆，另有一個動人的傳說。
相傳上天玉皇也是個貪財愛吃的人。有一年，武夷山因爲受了災，人們在大年三十夜晚拿不出三牲祭天。玉皇十分惱火，于是禦筆一勾，要讓武夷山大旱三年，所有神龍不准到那裏行雲播雨，以示懲罰。
第一個旱年，人們搶水搶種，總算還收了點山芋、蘿蔔，勉強熬過去了。第二個旱年，人們只能挖草根，剝樹皮，熬點稀湯苦度著。到了第三個旱年，大人餓得皮包骨，小孩餓得剩把筋。哀號連天，餓殍遍地，慘不忍睹！
哭聲飄到天庭，玉皇聽見了。他捋著胡子，飲著瓊漿得意地說：“嘿，誰叫你們祭天沒三牲呀，現在就該知道冒犯天意的滋味兒了吧！”哭聲也被上天的小神龍聽見了，小神龍于心不忍，就在一個夜間偷偷地來到武夷山，對著武夷山“嘩嘩嘩，嘩嘩嘩”噴下了一場大雨，解除了武夷山的旱情。
第二天，玉皇聽到下界傳來陣陣歡歌聲。怪了，哭聲怎麽沒啦？玉皇打開天窗一看，哎呀呀，只見武夷山一帶枯樹重綠，茶葉泛青，旱地溢水，人們正忙著翻耕播種。嚇！是誰敢抗旨私降甘霖？玉皇一查，知道是小神龍幹的，不由氣得七竅冒煙。就傳旨叫巨靈神把小龍打落凡間，要它在大地蟄伏，受罪千年，千年以後才能重新被召回天宮。
小神龍被巨靈神狠打一鞭，震昏了過去，“撲通”一聲，從天上摔下來，跌落在它曾降過甘雨的武夷大地上，淹埋在泥石中。從此，武夷山人又遭到玉皇的懲罰，三年兩頭荒，山禿禿，草茫茫，人們生活好苦呐，苦難的人們多麽惦念好心的小神龍啊！
一年一年累成十年，十年十年累成百年，百年百年累成千年。這一夜，沈沈昏睡的小龍突然聽到玉皇頒來的神旨：
“小龍，小龍，今日你大罪已滿，等會聽到雷聲一響，你要騰身百丈，千萬莫要回頭，不然休想回到天庭！”
小龍蘇醒了，理理龍須，舔舔龍鱗，心裏又歡樂又悲傷。小龍“呼噜噜”打個噴嚏，地動山搖，把熟睡著的鄉民們驚醒了。大家不知發生了什麽事，就跑出屋來。突然，天空中“喀喇喇”一聲響雷，大地上火光一閃，冒出了一條晶瑩美麗的神龍，這神龍就是小龍呵。隨著雷聲，小龍淩空躍上百丈。人們見了小龍，齊刷刷跪在地上，同聲呼喚：
“小神龍，小神龍，武夷老少盼又望，求你快把甘霖降！”
小龍聽見了，知道這一帶人們受盡旱災之苦，多麽想回頭噴點雨水呀！可是，就爲了降點雨水已受罪千年，難道還要再遭第二回罰麽？
這時，天空中又響起“喀喇喇”的雷聲。小龍歎了口氣，隨著雷響，又躍上了一百丈。人們又齊聲呼喚：
“小神龍，小神龍，武夷老少盼又望，求你快把甘霖降！”
小龍心裏好難受呵，他多麽想回頭望望蟄伏了千年的大地和武夷山的鄉親呵！可是，一回頭就再也回不到天宮啦！他只能搖搖頭，隨著天空中第三聲“喀喇喇”的巨響，又騰空躍上一百丈。人們又齊聲呼喚：
“小神龍，小神龍，武夷老少盼又望，求你快把甘霖降！”
眼看再一躍騰，就可挨上雲端了。挨上雲端就可重回天庭啦。可是，此時小龍兩耳充滿了武夷鄉親的深切呼喚，他再也忍不住了，于是就不顧一切地回過頭來，對著久旱的大地和盼雨的人們，張開大口“嘩嘩嘩，嘩嘩嘩”噴灑著甘雨。
“喀喇喇”，一聲驚天動地的霹雳，小龍被打下了武夷四曲大藏峰下的深潭裏，再也不能騰空飛天了。
爲了武夷大地，爲了武夷鄉民，小龍甯願不回天宮，受罰深鎖潭底，常年累月給人們噴霖灑雨。從此，武夷大地不再遭旱，群山披綠，百澗爭流，到處郁郁蔥蔥，一派生機，人們過上了富庶的生活。人們爲了紀念小神龍，就把小神龍藏匿的那泓深潭，叫做“臥龍潭”。
