武夷山自然保護區適宜多種生物繁衍，據調查資料記載，植物種類達3000多種，在動物方面，有“亞熱帶動物園”之稱。區內有野生動物獸類近百種，鳥類300多種，兩棲類33種，爬行類73種，昆蟲類5000多種和其他水生動物。武夷山珍稀動物多出于自然保護區，保護區以昆蟲、脊椎動物和其他生物新種和模式標本的采集聖地而聞名于世。清康熙三十八年(1699)，美國人Jcaminfham第一個進入武夷山桐木村一帶采集植物標本。同治十二年九月(1873年10月)，法國人Dauid神甫到桐木、挂墩采集標本，發現不少鳥類、哺乳類新種，光緒二十二年三月(1896年4月)和民國14年(1925)，英國人Catouohe和美國人Pope、德國人Schmiat等先後慕名多次到挂墩、三港，采集大量爬行類、西棲類動物標本，發現脊椎動物新種62種。民國26年，德國人克拉伯希(Klappevich)在崇安、邵武、光澤一帶采集動植物標本數十萬號，發現600多個新種。民國26年、民國34年，我國生物學者鄭作新和何景、浙江籍學者馬俊超等先後在大竹岚一帶采集昆蟲、鳥類及植物標本60萬號4000余種，發現大量新種。中華人民共和國成立後，國內一些科學研究部門、高等院校師生不斷到武夷山調查和采集標本。 1979、1981年，福建省科委組織38個教學科研單位的130多名教授、科技工作者開展綜合考察，共采集動植物標本25萬份，發現新種23個、新變種1個，其中中國新紀錄17個、福建新紀錄133個、武夷山新紀錄28個。1981年夏，福建林學院與保護區聯合調查武夷山竹類植物，采集標本36號200份，鑒定出武夷山竹類10屬，28種，3個變種，1個變型，6個新種，3個新變種，1個新組合，3個未定名。同年9月，上海自然博物館植物專業組調查武夷山苔藓植物，采集苔藓標本1400號、地衣標本5000號、蕨類標本320多號，初步鑒定出武夷山苔藓200余種、地衣100余種，發現許多經濟價值很高的苔藓林和奇特種類分布。 1982年3月初，福建林學院俞新妥教授考察保護區，發現天然杉木優種群落集中分布，還出現樹齡800∼900年的紅豆杉、檫、細柄阿丁楓，鈎栲等樹王，爲福建省已發現的最大樹王。 1987年3月25日，聯合國人與生物圈計劃國際協調理事會執行局(巴黎)會議，決定將武夷山自然保護區列入國際生物保護圈區網。同年9月7日，由聯合國教育、科學、文化組織人與生物圈計劃組織總幹事阿馬杜─馬赫塔爾·姆博根據人與生物圈計劃國際協調理事會議授權其主席團作的決定，將武夷山自然保護區列爲國際生物圈保留地網的組成部分。
武夷山特有動物
1、華南虎
2、耳長似驢的蘇門羚
3、白蟻克星——穿山甲
4、飛鼠
5、凶猛的紅春豹
6、狡猾的豺狗
7、笨拙的黑熊
8、山珍野味——花面狸
9、長吻鼹
10、銀絲竹鼠
11、隐纹花松鼠
12、會躲進農舍的麂
13、红面猴
14、银衣王子——白鹇
15、金衣公主——黄鹂
16、身挂绶帶的角雞
17、占山爲王的鹧鸪
18、鑿崖成巢的藍翡翠
19、羽冠奇特的戴勝
20、與牛共處的八哥
21、鳥中的模範丈夫——伯勞
22、敢鬥老鷹的黑卷尾
23、神秘的杜鹃
24、會飛的貓——猴面鷹
25、嗜食花蜜的太陽鳥
26、樹木醫生——啄木鳥
27、蛇類射手——眼鏡蛇
28、咬人不痛的銀環蛇
29、吻尖上翘的五步蛇
30、生小蛇的竹葉青
31、“蛇王”——麗棘晰
32、“怪龜”——平胸龜
33、角怪
34、蛙類山珍——石鱗
35、田坂“狗吠”是虎纹蛙
36、會“彈琴”的彈琴蛙
37、上樹産卵的大樹蛙
38、魚類新種——武夷厚唇魚
39、武夷山裏的娃娃魚
40、長腳的“山泥鳅”
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